Về cơ bản, có 2 cụm công trình cách nhau 400 m, kết nối bằng đường bộ hành tạo nên hệ thống ga Musashi-Kosugi. Cụm phía Tây bao gồm ga JR cho Tuyến Nambu và ga Tokyu cho các tuyến của Tokyu nằm ở tầng 2 của một khu thương mại. Cụm phía Đông là một phần của Tuyến Tokaido bao gồm Tuyến Yokosuka, Tuyến Shōnan-Shinjuku cùng với đó là 2 đường ray của tuyến Tokaido Shinkansen, tuy nhiên tàu Shinkansen không dừng lại tại đây. Mặc dù cách nhau khá xa về mặt địa lý nhưng hai nhà ga của JR vẫn mang tên chung.